30 septiembre, 2009

Relájate, el CO2 no es contaminante

En Norteamérica, una extraña campaña publicitaria promueve que el CO2 es bueno para nosotros y todo lo que se dice acerca del cambio climático no está científicamente comprobado. Según el video, el incremento del CO2 es, en realidad, beneficioso para los ecosistemas del planeta. Los accionistas de Natural Resource Partners, han invertido un millón de dólares en esta campaña llamada co2isgreen.

Ellos dicen que bajas concentraciones de CO2 es perjudicial para las plantas ya que inhibe su crecimiento y, por lo tanto, la producción de alimentos. Todos estamos de acuerdo que las plantas necesitan del CO2 para poder desarrollarse, ya que es la fuente de carbono que usan para poder elaborar sus nutrientes y bloques de construcción de todos sus componentes celulares. Pero, más CO2 no hace la diferencia, ya que las plantas no usan todo el CO2 que hay en el ambiente, el CO2 nunca ha sido un limitante para el desarrollo de las plantas, el único limitante es el agua.

Otra de las cosas que dicen es que el hombre inhala y exhala CO2 a cada momento, así que, el CO2 no es tóxico para él. Si, obviamente inhalamos CO2 en cada respiro que hacemos, pero así como entra, también sale. El CO2 no lo necesitamos, es más, lo eliminamos como desecho de nuestro metabolismo celular. Si lo desechamos, quiere decir que si lo retenemos nos puede hacer daño, así que no es cierto lo que dicen acerca de la inocuidad del CO2.

Bueno, hay una serie de puntos de vista que tienen, que no se si es para reírse o llorar, pero de lo que si estoy seguro es que cuando las compañías tienen plata, no reparan en gastos para persuadir al público que lo que hacen no tiene ningún efecto sobre los ecosistemas; es más, gracias a ellos el mundo mejorará… lobistas¡

Vía CO2isgreen y Plants Need CO2.

29 septiembre, 2009

Nubes espectaculares

Cuantas veces hemos visto nubes que tienden a aglomerarse de formas muy raras, dependiendo de la rapidez del viento, la cantidad de humedad y la temperatura; que hace que las nubes adquieran formas muy extrañas. En este recuento veremos algunas de las formaciones nubosas más extrañas registradas por fotógrafos en el mundo.

En el golfo de Carpentaria en Australia es muy conocido el fenómeno de La gloria de la mañana. Este tipo de nubes, que forman tubos de más de 1000km de longitud y unos pocos cientos de metros de ancho, se forman debido a la geografía de la península. Esta disposición se da por el encuentro de los vientos cálidos de la península con los vientos fríos del mar.

Las nubes mamuts son una de las más extrañas y están asociadas, generalmente, a tormentas. Tienen forma de burbujas y se creen que se generan por un rápido descenso de la temperatura en el interior de la burbuja.

Las nubes lenticulares, se parecen mucho a OVNIs, pero su origen se debe a la velocidad de choque del viento. Cuando el viento va a una determinada velocidad y choca con algún accidente geográfico como una montaña, se crean ondas gravitacionales. Este tipo de nubes se forman en el punto donde estas ondas más fuertes.

Una de las nubes más graciosas es la que adquiere la forma de las ondas de Kelvin-Helmholz. Este tipo de nubes se forma cuando el vapor de agua, con una densidad más alta, avanza a una velocidad diferente a la del aire, con una densidad más baja. La fricción hace que se formen este tipo de olas.

Para terminar, este tipo de nube media apocaliptica, que parece sacada de una película como Día de la Independencia o el Día después de mañana, es del mismo tipo que la primera (The morning glory), que se da generalmente en los frentes de tormenta. Esto se da por que el aire frío, que siempre está más arriba donde las temperaturas son más bajas, baja rápidamente debido a su densidad que es mayor a la densidad del aire caliente que se encuentra más cerca a la tierra, donde las temperaturas son mayores. Esta rotación y movimiento del aire cálido y frío crean una nube en forma de un tubo o una pared, que en peores casos puede desatar una gran tormenta eléctrica y tornados.

 

Como podemos ver no hay nada que la física no pueda explicar.

Vía WiredScience.

27 septiembre, 2009

Enfermedades misteriosas

La CNN ha publicado un artículo de 10 enfermedades muy extrañas y muy poco conocidas, muchas de ellas no las había escuchado antes ni siquiera en Dr. House.

El Síndrome de Morgellons es una extraña sensación de hormigueo, mordeduras y picaduras en la piel, y posteriormente, la emergencia de extrañas fibras azules, negras o rojas. Aún los científicos no se han puesto de acuerdo si esta condición es realmente una enfermedad y si es contagiosa.  Muchos creen que puede tener un origen psicológico por no detectar ningún organismo infeccioso envuelto en los síntomas de esta enfermedad.

La Progeria es una enfermedad congénita que se caracteriza por un envejecimiento prematuro, los que poseen esta enfermedad tienen una esperanza de vida de tan solo 13 años. A partir de los 9 meses se puede empezar a apreciar sus efectos por desarrollo anormal de la cabeza, que tiende a formarse como la cabeza de un alien, con los ojos muy grandes y la mandíbula pequeña. A la edad de dos, ya se empieza a perder el pelo y la visión empieza a fallar, siendo necesario el uso de anteojos. Finalmente empiezan los dolores de las articulaciones y finalmente la muerte por un paro cardiaco en el 90% de los casos.

La alergia al agua , es una condición extremadamente rara, sólo se conocen unos 30 casos hasta el momento. Se empieza a ver los síntomas a muy avanzada edad, generalmente pasada la adolescencia. Los que tienen esta rara enfermedad presentan ronchas o erupciones en la piel al contacto con el agua, algunos son alérgicos a los componentes del agua de caño como los iones calcio, sodio o magnesio, otros son alérgicos a la misma agua. Deben embeber su piel con cremas oleosas para que el agua pueda escurrir y beber agua tratada tomando algunos antihistamínicos.

La siguiente enfermedad es una de las más extrañas. El síndrome del acento extranjero es un extraño trastorno del habla que la persona que lo posee empieza ha hablar con un acento diferente a su acento original, es como si hablara como un alemán que recién aprendió el español. En nuestro país no estamos muy alejados de esta enfermedad, es más tenemos una centenar de estos casos, los más conocidos son de los reguetoneros peruanos que hablan como boricuas, o salseros peruanos que hablan como venezolanos, o becados que regresan de España que hablan posh nada como eshpañoles vale.

La enfermedad de la risa, más conocida como Kuru fue exclusiva de las tribus de Nueva Guinea, donde los que la padecían reían a carcajadas de manera incontrolable. Con el tiempo las piernas empiezan a temblar, el cuerpo a balancearse y los ojos a salirse de su órbita, posteriormente llega la muerte. Los estudios realizados en las personas que padecían de esta enfermedad demostraron la aparición de unos agujeros en el cerebro, como en un queso suizo. Se observó que también era contagiosa, ya que estas tribus acostumbraban a comer a sus muertos. Cuando se detuvo el canibalismo, la epidemia cesó.

La fibrodisplasia osificante progresiva afecta a una de cada dos millones de personas en el mundo donde los tendones y ligamentos sufren una extraña metamorfosis, transformándose literalmente en hueso (mitosis oscificante) perdiendo la movilidad de la articulación. En casos más severos todo el tejido se ha osificado, que solo se podía mover la boca.

El síndrome de Alicia en el país de las maravillas es un desorden neurológico que hace que las personas perciban las cosas de un tamaño menor al que son; también suelen parecer más lejanos de lo que verdaderamente están. Esta enfermedad también puede estar asociada a migrañas, tumores cerebrales y consumo de sustancias psicoactivas. Pueden presentar señales iniciales del virus Epstein-Barr.

La porfiria hace que los orines y las heces se vuelvan purpuras. Es una enfermedad metabólica que afecta la producción del “grupo heme”, importante componente de la hemoglobina, principal proteína de los glóbulos rojos, afectando la piel y el sistema nervioso. El grupo heme fallido actúa como una toxina afectando el color de ciertas partes de la piel, especialmente cuando son expuestas al sol.

La pica es un trastorno alimenticio que hace que la persona coma de todo, especialmente, sustancias no nutritivas y poco saludables como pintura, tierra, yeso o, alternativamente, ingredientes de muchos alimentos como sal, harina, etc. Muchos investigadores han relacionado la pica con problema de deficiencia de minerales. Además, este problema no es exclusivo del hombre, se ha reportado en ciertos animales.

Y para terminar, el síndrome de Moebius es una enfermedad congénita extremadamente rara, que se caracteriza por una parálisis facial completa. Los que la padecen no pueden cerrar sus ojos, mirar de un lugar a otro o mostrar alguna expresión facial. Pueden llegara  tener problemas para alimentarse, falta de sonrisa y babeo excesivo.

Más juegos para biólogos

En Sneeze tu eres un virus de la gripe que debes propagarte cada vez más, según el nivel que avanzas. Mediante un estornudo infectarás a un cierto número de personas, estas a su vez infectarán a más propagando la enfermedad por todo el espacio de juego. Por cada niño que infectes te dan 5 puntos, por ser más vulnerables; por cada adulto te dan 10, por ser más resistentes e inmunes a la enfermedad y 15 puntos por cada anciano por tener menos contacto con las personas y menos capacidad de diseminar la enfermedad. Divertido al comienzo, solo llegue al nivel 6 (45%).

sneeze

The Killer Flu es un juego en donde debes infectar a un mayor número de personas a través de diferentes mapas. Existen diversos personajes, cada no con sus características propias de inmunidad a un tipo de gripe. Cada uno de los personajes tienen distintos tipos de trabajos y lugares donde frecuentan con un cierto número de personas. La idea es infectar al mayor número de personas en el menor número de días, dependiendo que tipo de gripe es. Más divertido que el anterior, pasé la gripe estacional en 35,6 días.

killer_flu

Si bien no son juegos para estar enviciados por días, nos puede entretener en nuestros ratos de ocio, mientras leemos un paper o hacemos un trabajo de la universidad.

25 septiembre, 2009

Las aventuras de BioUnalm en la UNALM

Este ciclo, BioUnalm comenzó con las pilas puestas. Estuvimos presentes en la bienvenida de cachimbos de la facultad de Ciencias e invitamos a los biólogos a unirse a nuestro grupo. Por cierto, les recordamos a todos los biologos de la Universidad Agraria La Molina que nuestra convocatoria sigue abierta por todo este mes.

También hemos retomado los Jueves Biológicos, que después de varios ciclos regresó para el deleite de todos ustedes. Los Jueves Biológicos son espacios en los que hablamos de temas relacionados a nuestra carrera, se llevan a cabo de 2 a 3 veces por mes de 2-4pm y el ingreso es libre.


Este ciclo, comenzamos con la ponencia: CONSERVACIÓN DE CAMÉLIDOS SILVESTRES: MANEJO Y USO SUSTENTABLE. Fue un tema muy interesante, pudimos aprender acerca de las especies de camélidos en Perú, sus características y más importantes y sobre todo la posibilidad de un uso sustentable de estos animales. Descubrimos que 1kg de fibra de vicuña cuesta $500, oh sí, han leído bien, y es por esto que la cacería furtiva es bastante común; aún cuando esta especie salió sólo hace algunos años del estado vulnerable. Si bien es ciertro, la vicuña se encuentra en un estado "menos preocupante", depende mucho de la conservación. Es decir, que sin la protección del hombre podría entrar nuevamente en riesgo. El huanaco también es amenazada por la caza deportiva, que va diezmando sus poblaciones.

Algunos de los comentarios de nuestros amigos de BioUnalm son:

Adrián Vera: "El jueves biologico se desarrolló con gran audiencia; la cual en su mayoría, como era de esperarse, fueron estudiantes de zootecnia, los cuales despejaron todas sus dudas con respecto al tema. En un momento surgió un debate sobre qué se considera como domesticacion, lo cual incentivó la participación de los asistentes y enriqueció la ponencia".

Paola Ortiz: "Asistir al primer jueves biológico organizado por BIOUNALM, resultó ser una experiencia muy interesante y al mismo tiempo preocupante. Me encantó conocer más sobre los camélidos que habitan en nuestro Perú, sobre su forma de vida y sobre el desarrollo sostenible que se quiere lograr con ellos, con un buen manejo y con la colaboración de diversas entidades interesadas en el tema. Por otra parte me entristeció el saber también que los esfuerzos hasta ahora hechos no son suficientes, y que en muchos casos a causa de la ignorancia, varias son las especies a las que no se les da la importancia, aprecio y cuidado que se les debería dar, como es el caso del Huanaco".

Almacena tu ADN para siempre

Por solo $299 puedes guardar tu ADN para la eternidad… Ya es conocido que Suiza posee los bancos más seguros y secretos del mundo, tal como muchos leímos o vimos en el Código Da Vinci; pero, también posee un banco para nuestro ADN…

En que consiste? Simplemente basta con ordenar tu kit de colección de ADN, lo mandas vía correo al Swiss DNA Bank y usando tu tarjeta personal provista por la empresa empiezas a cargar tus fotos y todo tipo de memorias que quedarán almacenadas para la posteridad juntamente con tu ADN. Y para que? Según la empresa, para guardar tus memorias y tu paso por la tierra para las futuras generaciones, para que tu huella perdura más allá de tu vida en la tierra.

La distribución se parece mucho al banco genético mundial del Ártico, lugar donde se encuentra toda nuestra reserva genética para el futuro. Hay una gran preocupación por la pérdida de la biodiversidad que estamos viviendo, frente a esto, las Naciones Unidas decidió adelantarse a las posibles catástrofes como el calentamiento global, la polución o las guerras, que pueden afectar irremediablemente a nuestra biodiversidad. Construido en medio del archipiélago de Svalbard, en pleno permafrost y en la zona más septentrional del planeta, es el lugar ideal por su distancia de cualquier civilización moderna. Está cúpula es capaz de resistir cualquier fenómeno natural y humano gracias a sus puertas blindada, su profundidad en la montaña y el grosor de sus paredes de concreto… es como un Arca de Noé del s.XXI que nos garantizará nuestra seguridad alimentaria en caso de algún cataclismo.

24 septiembre, 2009

Phage Wars 2, un juego para microbiólogos

Digamos que eres un biólogo que trabajas para Osama Bin Laden, y te encarga crear un virus que sea sumamente infeccioso y mortal. Esto es, en líneas generales, en lo que consiste este juego. Debes crear la bacteria más poderosa usando la ingeniería genética a través de la inserción de una variedad de genes que le da nuevas habilidades a nuestro agente infeccioso; además, podremos hacer una serie de pruebas en diferentes cultivos celulares y analizar nuestros resultados en tiempo real; todo esto con el fin de infectar al mayor número de organismos, compitiendo con otros virus diseñados por la misma empresa en la cual nosotros estamos trabajando. Los genes que podemos insertar en el genoma de nuestro corresponden a proteínas que proporcionan rapidez, resistencia, fuerza, agilidad y reproducción.

phage_wars

He jugado un par de partidas para probarlo pero no he podido ganar ni una. Cada uno comienza con una célula con 100 puntos, la idea es repartir esos puntos entre todas las células del cultivo celular, los genes son importantes porque te ayudarán a propagar tu material genético de manera más rápida y eficiente.

phage_wars1

Para jugarlo visiten el siguiente link: Phage Wars 2.

22 septiembre, 2009

Cielo rojo en Australia, será el apocalipsis?

Recuerdo cuando llevaba religión en el colegio, en uno de los capítulos del apocalipsis hablaba acerca del fin del mundo y unos jinetes con unas trompetas, y algo sobre que el cielo se pondría rojo como la sangre. Esta mañana -23 de septiembre- en Sydney, el cielo amaneció completamente rojo, un espectáculo nunca antes visto sobre esta ciudad.

No soy meteorólogo ni climatólogo para poder explicar este fenómeno correctamente, solo puedo decirles que me asombró bastante las fotos tomadas de esta tormenta de arena. Muchos habrán visto documentales sobre Australia, y se habrán dado cuenta que sus desiertos tienen un color rojizo, al parecer fuertes vientos que soplan en la zona y la poca humedad provocaron este acontecimiento, esto sumado a los rayos solares mañaneros que son rojizos o anaranjados, debido a la dispersión de la luz en la atmósfera.

Bueno, es una forma de decir que ya llegó la primavera…

21 septiembre, 2009

The Western Blot Race

Para los que no saben, un Western Blot es la transferencia de las proteínas separadas mediante electroforesis de los geles hacia una membrana, que puede ser de nitrocelulosa, que está marcada con sondas específicas para la proteína que nosotros deseamos detectar o identificar. Este proceso, con los métodos tradiconales, toma aproximadamente de 2 a 3 horas, y la técnica es bastante compleja y hay que tener bastante entrenamiento para hacerlo bien.

La empresa Millipore ha lanzado al mercado su nuevo producto, el SNAP i.d. una novedosa cámara de Western Blotting que hace todo el trabajo de manera rápida y sencilla, sin la necesidad de usar muchos reagentes químicos. Para demostrar la rápidez y compararla con los métodos y equipos tradicionales, Millipore ha hecho una publicidad muy divertida, en la cual se explica de manera sencilla en que consiste este proceso.



Lo que me causa bastante risa es lo prejuiciosos que son con los indios. La India, al igual que la China, se están convirtiendo en productores y exportadores de nuevas tecnologías copias de equipos producidos por reconocidas empresas como Applied Biosystems o BioRad, y sus productos están entrando al mercado con bastante fuerza; esto debido a sus bajos precios, o como dicen por ahí: "la mano de obra es China, pero la trecnología es Norteamericana", osea, al final es lo mismo comprar un termociclador marca Roche que uno marca Shin Huan Shong (suena como a chifa verdad?) ya que los dos dicen Made in China, aunque en nuestro país también exportamos nuestros equipos Made in "caChina".

Otra cosa más es que, estos equipos por ser indios o chinos, no durán más de dos años. En los países desarrollados, dos años es más que suficiente para que un equipo cumpla con su vida útil, ya que la tecnología avanza de manera tan rápida que en dos años ya salió un nuevo producto al mercado, diez veces mejor que su predecesor. Así que para que pagar $25000 por un termociclador iCycler de BioRad que en dosw años será cambiado por uno más moderno, si por menos de la mitad compramos uno chino que nos durará dos años antes que se malogre.

Bueno, regresando al Western Blot, este equipo nos reduce el trabajo a sólo media hora. Esto quiere decir que en las dos horas y media que ahorras, te mandarán a hacer otra cosa. Si quieren ver el mecanismo, visto técnicamente visiten el siguiente enlace.

20 septiembre, 2009

Quién dice que las peceras son solo para los peces?

Los acuarios y peceras no solo son recipientes de vidrio donde criamos a nuestros coloridos peces; muchas personas los utilizan como jardines acuáticos, donde lo más importante no son los goldfish, sino, las plantas que crecen dentro de ellas. Muchos entusiastas de este arte recrean verdaderos paisajes naturales dentro de un tanque.


“Mountainscape” ganador del Aquascaping Contest 2008

Este tipo de arte, al igual que los bonsai, son muy populares en el oriente y poco a poco se va difundiendo por todo el mundo. Para aquella gente emprendedora, este sería un buen negocio ya que en nuestro país no hay un lugar donde se venda o exhiba este tipo de trabajos. Tal vez por ahí unos pocos aficionados que, al morirse todos sus peces, no vieron una mejor opción que criar las algas que quedaban en ellas.

 
“Field of Dreams” ganador del Aquascaping Contest 2007

Para ver la galería de imágenes visiten el siguiente enlace.

Impresoras de tejidos

Navegando por ahí encontré un video, algo ruidoso, del mecanismo de funcionamiento de una impresora de tejidos celulares. Este equipo permite diseñar estructuras en tres dimensiones usando soportes de canales de hidrogel.

Y ahora con toda la revolución de las células madre, podríamos crear cualquier órgano desde cero, y mediante estímulos bioquímicos, inducir a que cada célula se diferencie de la manera correcta.

19 septiembre, 2009

Secuenciado el genoma de Phytophthora infestans

Phytophthora infestans es el patógeno más destructivo de la papa, nuestro producto bandera, originario de los andes y que es el cuarto cultivo más importante del mundo -después del arroz, trigo y maiz. Este hongo perteneciente a la clase de los oomicetos, es causante del tizón tardío o rancha de la papa, una enfermedad que, en nuestro país, arrasa con centenares de hectáreas de cultivos de papa y que en la década de 1840 fue la causa de la hambruna Irlandesa. Las pérdidas económicas producidas por este patógeno están estimadas en 6700 millones de dólares al año (en el mundo), por lo tanto, es necesario desarrollar nuevas estrategias, usando la biotecnología, para contrarrestar sus efectos; siendo el primer paso para lograr este objetivo, conocer a fondo su genoma.

ResearchBlogging.orgEl trabajo de secuenciamiento fue liderado por investigadores del MIT de Estados Unidos. Con una cobertura de 9X, se secuenció el genoma de P. infestans. Con 229Mb, esu genoma es mucho más grande que de sus parientes cercanos P. ramorum (65Mb) y P. sojae (95Mb). El genoma completo de P. infestans presenta 17797 genes codificantes de proteínas. Su genoma está compuesto por una serie de efectores y moduladores con la capacidad de alterar la especificidad de la célual hospedadora.

Al compararlo con los genomas previamente secuenciados de dos de sus especies relacionadas se observó una organización del genoma muy inusual, con regiones de alta densidad de genes conservados separados por grandes espacios de elementos repetidos y genes no conservados. También posee una gran proliferación de elementos Gypsy (transposones) conformando aproximadamente el 29% del genoma y una gran diversidad de transposones del tipo helitrones (se replican por el mecanismo del círculo rodante). En total se identificaron 273 helitrones, los cuales fueron clasificados en 2 grandes grupos con elementos de 7.3kb y 6.4kb, los más grandes descritos hasta el momento.


Orden de los genes conservados en los genomas de tres especies de Phytophthora. Se nota claramente la expansión del genoma debido al aumento de elementos repeditos en las regiones intergenéticas. Los genes se muestran como barras turquesas y los elementos repetidos como barras negras.

P. infestans secreta proteínas efectoras que alteran la fisiología del hospedador y facilitan su colonización. Estos efectores han sido clasificados en dos grandes categorías: los efectores apoplásticos, los cuales se acumulan en los espacios intercelulares y están conformados por enzimas hidrolíticas (lipasas, proteasas y glicosilasas) e inhibidores enzimáticos que los protege del mecanismo de defensa de la planta; y los efectores citoplásmicos que modifican el metabolismo celular de la planta, los cuales ingresan mediante haustorios.

Entre los efectores citoplásmicos tenemos a las proteínas RXLR que presentan el dominio conservado amino terminal Arg-X-Leu-Arg, el cual es requerido para entrar en la planta. Usando herramientas bioinformáticas se ha predecido al menos 563 genes RXLR en el genoma de P. infestans. Estos genes se encuentran en constante cambio debido a la carrera armamentista co-ecolutiva entre el hospedador y el parásito. Los efectores CRN codifican para péptidos que provocan la necrosis de la planta. Se detectaron al menos 196 genes CRN los cuales poseen una región N-terminal altamente conservada de unos 50 aminoácidos (el dominio LFLAK). Algunos de los miembros de esta familia de genes inducen la secreción de otras proteínas que favorecen la colonización de la planta. Tanto los genes RXLR como CRN tienen un rápido nacimiento y evolución, por esta razón este patógeno ha sido tan devastador. Muchos de los genes de P. infestans son reprimidos durante la infección para evitar la activación de la inmunidad de la célula hospedera.

En fin, el secuenciamiento de su genoma es una herramienta clave para entender el éxito de su patogenicidad. Con este estudio se ha deteminado que P. infestans posee un alto porcentaje de contenido repetido (aprox. 74%), una distribución inusual de sus genes, regiones genéticamente densas separadas por regiones ricas en elementos repetidos, efectores patogénicos con una evolución constante y un aumento de genes CRN y RXLR. Ahora, el siguiente paso es desarrollar estrategias biotecnológicas que nos permitan hace frente a este temible patógeno.

Haas, B., Kamoun, S., Zody, M., Jiang, R., Handsaker, R., Cano, L., Grabherr, M., Kodira, C., Raffaele, S., Torto-Alalibo, T., Bozkurt, T., Ah-Fong, A., Alvarado, L., Anderson, V., Armstrong, M., Avrova, A., Baxter, L., Beynon, J., Boevink, P., Bollmann, S., Bos, J., Bulone, V., Cai, G., Cakir, C., Carrington, J., Chawner, M., Conti, L., Costanzo, S., Ewan, R., Fahlgren, N., Fischbach, M., Fugelstad, J., Gilroy, E., Gnerre, S., Green, P., Grenville-Briggs, L., Griffith, J., Grünwald, N., Horn, K., Horner, N., Hu, C., Huitema, E., Jeong, D., Jones, A., Jones, J., Jones, R., Karlsson, E., Kunjeti, S., Lamour, K., Liu, Z., Ma, L., MacLean, D., Chibucos, M., McDonald, H., McWalters, J., Meijer, H., Morgan, W., Morris, P., Munro, C., O’Neill, K., Ospina-Giraldo, M., Pinzón, A., Pritchard, L., Ramsahoye, B., Ren, Q., Restrepo, S., Roy, S., Sadanandom, A., Savidor, A., Schornack, S., Schwartz, D., Schumann, U., Schwessinger, B., Seyer, L., Sharpe, T., Silvar, C., Song, J., Studholme, D., Sykes, S., Thines, M., van de Vondervoort, P., Phuntumart, V., Wawra, S., Weide, R., Win, J., Young, C., Zhou, S., Fry, W., Meyers, B., van West, P., Ristaino, J., Govers, F., Birch, P., Whisson, S., Judelson, H., & Nusbaum, C. (2009). Genome sequence and analysis of the Irish potato famine pathogen Phytophthora infestans Nature, 461 (7262), 393-398 DOI: 10.1038/nature08358

17 septiembre, 2009

Un viaje a través del cuerpo

Espectacular animación que nos muestra un viaje transversal a traves de nuestro cuerpo, desde nuestro cerebro hasta la punta de nuestros pies, que órganos pueden identificar?

Cirugías en los años 30

Navegando por ahí, encontré unos videos de cirugías que fueron grabados en los años 30, que muestran una serie de complicadas operaciones, como la extracción de un tuberculoma del cerebro o una ovariotomía donde extran un tumor del tamaño de un zapallo, utilizando herramientas que encontramos en cualquier taller mecánico de la Avenida Canadá.


Estos videos me han parecido espectaculares. El solo hecho de ver como se hacían este tipo de cirugías hace décadas atrás, cuando no se tenían herramientas y equipos que permitieran extraer tumores o sacar piedras de la vesícula con simples pinzas, a través de una simple cirugía laparoscópica y donde no se daba mucha importancia a la asepsia del lugar, exponiendo al organismo a graves infecciones.


Si bien parecen películas tipo cine mudo o cortos del genial Charles Chaplin, son videos hechos por la Asociación Médica Británica, quienes los han publicado gracias a The Wellcome Library a través de su canal de Youtube.

16 septiembre, 2009

Serpiente con patas

Muchos ya habremos escuchado sobre esta rara serpiente con una pata que fue encontrada en China, pero por qué se dio esto?

snake

Las serpientes son reptiles al igual que los cocodrilos y las lagartijas, todas ellas tienen patas, pero las serpientes no, esto por fuerzas evolutivas que en la serpiente, no tener patas, es una ventaja para su supervivencia. Pero, también sabemos que los genes son pleiotrópicos -un mismo gen puede tener varias funciones. En este caso, los genes Hox, han evolucionado de tal manera que se ha suprimido el desarrollo de las patas por mecanismos de regulación genética; en otras palabras, las serpientes también poseen los genes que son los encargados de generar las patas en los reptiles, pero están regulados para no expresarse. Por algún factor ambiental o bioquímico, este gen se desreguló y provocó que la pobre serpiente tenga una pata y sea el hazmerreír de todas las serpientes.

Una conclusión que podemos sacar es que, en realidad, las serpientes han evolucionado de un ancestro con patas, esto sería un punto a favor para los evolucionistas. Si este tipo de "afloramientos" evolutivos también se dieran en el hombre, por ahí puede aparecer un hombre con cola, osea un sayayin.

Vía Telegraph.

15 septiembre, 2009

Participa¡¡

SEMANA DE BIOLOGIA 2009
Primera Reunion de Coordinacion
Gente un año mas se celebra el Día del Biologo (27 de Noviembre) y un año mas tenemos que celebrarlo a lo grande, pero solo se puede quedar en intencion si no es por el apoyo de todos ustedes. Sus ideas y aportes son necesarios.
Eres biologo y estas orgulloso de serlo???
Ven al Federado este Jueves 17 a la 1.00 pm
Unete y Participa!!!!! solo faltas tu !
Difunde este mensaje!!!!
Este es un aviso biologistico contratado.-

12 septiembre, 2009

El crustáceo te comió la lengua

Los monstruos que vemos en las películas son, muchas veces, inspirados en el mundo natural. Muchos son insectos o cefalópodos con malformaciones genéticas y tamaños impresionantes, pero, este parásito encontrado en las costas de New Jersey, parece que ha tomado como modelo uno de los mostruos de las películas, me hace acordar mucho al monstruo de Cloverfield.



Este isópodo fue encontrado dentro de un pez tejedor. Pero que tiene de raro esto? Todos los parásitos siempre están dentro de algo. Este bribón se comió la lengua del pez y tomó su lugar. Al parecer no le causa ningún daño, a excepción de que se comió su lengua y el pobre pez ya no podrá saborear los deliciosos potajes marinos.

Sin dudas esta imagen es algo tenebrosa, como sacada de cualquier película de terror y cambiará el sentido a la famosa frase: "Que pasa, por qué tan callado, acaso el ratón te comió la lengua?"

11 septiembre, 2009

Mariposa cósmica

Como seguimos en el año intrenacional de la astronomía, informaremos que el telescopio espacial Hubble está de vuelta. Tras un breve periodo de reparación y mejoramiento, este conocido aparato volvió a captar imágenes asombrosas de los lugares más recónditos del universo. Gracias a sus nuevos filtros y detectores podemos ver imágenes en el espectro infrarojo, ultravioleta y otras longitudes de onda más. También cuenta con unos sensores espectroscópicos que permiten determiar hasta la composición química del astro que está siendo observado.

Una de las imágenes más asombrosas que ha dado la vuelta al mundo y ha marcado el retorno del telescopio Hubble, fue de la galaxia NGC 6302 que tiene la forma de una gran mariposa.


Y esto que tiene que ver con la biología? Pues mucho. Con estos nuevos equipos con los cuales ha sido equipado el telescopio Hubble, podemos determinar la composición química de estos astros, aunque será la composición química que tenían hace miles o hasta hace millones de años atrás, pero nos ayudará a comprender mejor como llegamos hasta aquí.


Vía HubbleSite.

10 septiembre, 2009

Como se propagó la gripe A H1N1

Analizando muestras de pacientes con la gripe A H1N1 de diferentes partes del mundo podemos determinar como se diseminó este virus hasta alcazar casi todos los países del mundo y convertirse en una amenaza a la salud pública. Cada virus tiene una composición genética que va cambiando a través del tiempo, gracias a ciertas mutaciones que se van dando dentro de su genoma. Determinando el origen de cada mutación podemos llegar a trazar un mapa de como se propagó a través del mundo desde su orígen, tal como lo podremos ver en el siguiente video:


Para trazar el origen de cada mutación basta con secuenciar determinados marcadores genéticos, en este caso los genes correspondientes a la Neuraminidasa (N1) y la Hemaglutinina (H1), y comparalras usando herramientas bioinformáticas de alineamiento de secuencias para poderdeterminar su árbol evolutivo y ver su origen. Luego aplicamos otras herramientas biomatemáticas para determinar la velocidad en que el virus se propagó usando datos de vuelos aéreos, número de infectados por región y otras pruebas estadísticas que ayuden a elaborar este perfil.


Vía Wiredscience.

09 septiembre, 2009

Microbiología en vidrio

El artista y escultor británico Luke Jerram ha creado verdaderas obras de arte inspirándose en los virus y bacterias; esculpiendo sus fascinantes formas en vidrio. Tenemos desde el muy conocido virus de la gripe A H1N1, pasando por la E. coli y el virus del VIH.


El objetivo principal de esta exhibición de Jerram es explorar la tensión que hay entre la belleza del arte y lo que ella representa, su impacto sobre la humanidad. Sus obras las hizo en vidrio no porque sea más bonito, sino, porque cree que los falsos colores que le damos a las imágenes científicas, muchas veces para hacerlas más didácticas, afecta nuestro entendimiento del problema. Las partículas virales no tienen los colores que se muestran en las figuras de los libros, muchos de ellos son transparentes, que gracias a los microscopios electrónicos modernos le podemos dar el color que querramos. Estas esculturas se asemejan más a la realidad, ya que a parte de la similaridad en la forma, mantienen las mismas proporciones que los virus originales ya que para realizar este trabajo consultó a virologistas expertos de la Universidad de Bristol.


Este video muestra como Jerram realiza estas verdaderas obras de arte. Para los que quieran ver esta exhibición en vivo, vallan a la Galeria Smithfield en Londres.


Vía Luke Jerram.

07 septiembre, 2009

Un año más

Un día como hoy, hace 3 años, fue fundada la Agrupación de Estudiantes de Biología de la Universidad Agraria - BioUnalm. En ese entonces, éramos sólo 11 integrantes, muchos de ellos -me incluyo- ya egresaron, otros, por cuestiones de la vida se resisten a dejar la universidad (Daniel, jaja) y otros se cambiaron de carrera. Cada año la agrupación se renueva, biólogos que vienen, otros que se van, otros que piden una licencia por un ciclo, pero todos dispuestos a apoyar en las actividades que desarrolle la agrupación por el bien de los biólogos molineros.

En ese entonces el fin de la agrupación era integrar a los estudiantes de biología, tanto de las carreras de ecología y de biotecnología; para eso se realizaban actividades no muy académicas como viajes, campeonatos y fiestas; ahora, con una estructura más sólida los fines y objetivos van cambiando y mejorando, enfocándose más en la parte académica, científica, de desarrollo profesional y de proyección social, sin dejar de lado la parte recreativa y cultural, con anticuchadas, panchadas, pan con polladas y bioladas.

A las pocas semanas de fundada la agrupación se creó este Blog, el cual ya se ha vuelto un referente en las ciencias de la vida de nuestro país. El primer fin del blog era difundir las actividades que realizaría la agrupación, así como citar a reuniones y dar a conocer la realidad  universitaria. Con el transcurso de los meses el blog cambió su temática hacia la divulgación científica, sin dejar de lado las actividades del grupo.

Los tiempos cambian, y BioUnalm se adapta a estos cambios y evoluciona tal como Darwin lo estipula, así que se cumplan muchos años más.

Ahora queda una pregunta: Donde es el tono?

06 septiembre, 2009

Ellos también pueden ser divertidos

Esta por demás decir que los biólogos somos muy divertidos y extremadamente extrovertidos, pero los paleontólogos tampoco se quedan atrás...


Así que próximamente saldrá los Genéticos de la Cumbia en su versión animada.

05 septiembre, 2009

Por qué las esporas no activan nuestro sistema inmunológico?

ResearchBlogging.org
A pesar que nunca nos demos cuenta, estamos rodeados por millones de esporas de hongos (conidias) que permanecen suspendidas en el aire todo el tiempo, la mayoría de estas conidias pertenecen a los géneros Cladosporium, Penicillium, Alternaria y Aspergillus. Las respiramos todo el tiempo, pero, por qué no generan una respuesta inmunológica al ingresar a nuestro organismo?

De por sí, estos géneros pueden llegar a producir infecciones como la Aspergilosis, la cual va a generar una respuesta inmunológica mediante la expresión de ciertas moléculas co-estimuladoras como la CD80, y de antígenos que inducirán la secreción de las citokinas como la HLA-DR que generan una respuesta inflamatoria. Los centinelas de toda esta cascada de reacciones son las células dendríticas. Pero, cuando estos hongos están en su estado dormante (conidias) no causan ningún tipo de respuesta inmunológica ni estimulan las células dendríticas a pesar que poseen los mismos componentes que activan estas respuestas, entonces, algo debe estar bloqueando estos receptores volviendo a las conidias inmunológicamente inertes.

Investigadores del Instituto Pasteur estudiaron las conidas del Aspergillus fumigatus y encontraron que estas estaban cubiertas por unas hidrofobinas llamadas RodA unidas a la pared celular a través de un anclaje glicosil-fosfatidil-inositol (GPI). Para la purificación de la RodA primero se rompió el anclaje GPI usando ácido hidrofluórico y luego se hizo un SDS-PAGE y se obtuvo 3 bandas: una de 32kDa, correspondiente a la forma dimérica del RodA; una de 16kDa que corresponde a la RodA nativa y una banda de 14.5 kDa, correspondiente a la RodA parcialmente degradada.

Cuando la conidia germina la RodA empieza a desaparecer por la degradación del anclaje GPI, esto dio una pista de que esta molécula sería la responsable de que se activen las células dendríticas. Una vez que se tuvo purificada la RodA se hicieron pruebas in vitro. Observaron que la presencia de RodA no inducía la maduración de las células dendríticas ni la activación de las células CD4+ T responsables de la producción de citokinas; a diferencia de la Aspf1, que es la proteína más inmunogénica que posee el hongo.

Para confirmar que la RodA presente en la pared celular es la responsable de la ausencia de respuesta inmonológica se crearon mutantes para el gen rodA. A diferencia que el hongo de tipo silvestre, este mutante si estimulaba a las células dendríticas. Este mutante también inducía la producción de citokinas.

Y finalmente, para demostrar que las hidrofobinas RodA regulan la respuesta inmunológica a las conidias in vivo, hicieron una inoculación transnasal en ratones de laboratorio. Las conidias silvestres no provocaban reacción alguna, pero, la conidia mutante y la tratada con ácido hidrofluórico, si activaron el sistema inmune del ratón. También se realizaron las mismas pruebas con las otras hidrofobinas de las conidias de los otros géneros y se obtuvieron resultados similares.

Este estudio es de vital importancia desde un punto de vista terapéutico. Usando la nanotecnología podemos crear nanopartículas y nanorobots que sean inoculados en un paciente con tumores muy dificiles de extirpar. Estos dispositivos tendrían la capacidad de hacer sirugías extremadamente complicadas con gran presición, pero para que nuestro organismo no genere una respuesta inmonológica ante la presencia de este organismo, las nanopartículas podrían ser recubiertas con esta proteína RodA.

Aimanianda, V., Bayry, J., Bozza, S., Kniemeyer, O., Perruccio, K., Elluru, S., Clavaud, C., Paris, S., Brakhage, A., Kaveri, S., Romani, L., & Latgé, J. (2009). Surface hydrophobin prevents immune recognition of airborne fungal spores Nature, 460 (7259), 1117-1121 DOI: 10.1038/nature08264

03 septiembre, 2009

Medusas

Sin duda, el mundo natural es un arte por sí solo. Unos científicos han publicado una galería fotográfica de medusas avistadas a 2600 metros de profundidad, durante su expedición submarina en el océano Ártico. Muchas de las especies avistadas son nuevas para la ciencia, otras simplemente han sido vistas en muy pocas ocasiones y no se tenía un registro fotográfico de ellas hasta ahora. 


También fue avistada una medusa que puede llegar a medir hasta 40 metros. Tampoco pueden faltar las muy conocidas medusas bioluminiscentes, que sin lugar a duda son las más fascinantes de todas.


Y para terminar con estas imágenes espectaculares he aquí un sinóforo de 3m. Para seguir viendo la galería de fotos visiten BBC - Earth News.

Pareidolia: Ponle corazón

La pareidolia es un fenómeno psicológico que se produce de manera inconsciente y continua cuando interactuamos y recibimos estímulos de nuestro entorno. Consiste en percibir formas reconocibles generalmente en imágenes pero que realmente no están ahí. Esto se debe a que nuestro cerebro tiene tendencia a buscar patrones reconocibles en todo lo que nos rodea o parecidos razonables, basandose en la información que ya existe en nuestra memoria. Es algo que no controlamos y que pasa sin querer porque así funciona nuestro cerebro de manera natural, aunque en algunos casos extremos puede ser patológico.

En el mundo natural se dan muchas pareidolias, así que abriremos una nueva categoría en nuestro blog dedicado a las pareidolias de origen biológico, esperamos sus aportaciones.

El ránking de las estructuras biológicas

Ya hemos visto que todas las cosas se basan en los rankings, en la importancia que tiene algo bajo ciertos parámetros. Entre los rankings académicos más conocidos tenemos el de las Universidades, Institutos de Investigación, Revistas Científicas y hasta los mismos científicos; pero, hacer un ranking de estructuras moleculares en 3D es algo que no se nos hubiera pasado por la cabeza.

Este tipo de ranking no es como los otros en los cuales tu votas a través de tu correo electrónico, y para que gane tu favorito, votas con todos los correos que tienes, es más, llegas a crearte nuevas cuentas. Para rankear a las estructuras biológicas en base a su popularidad en el mundo científico, se tomó en cuenta dos parámetros: El primero fue el número de veces que la molécula ha sido citada en un artículo científico publicado en una revista arbitrada, estos datos fueron obtenidos de la Base de Datos Central de PubMed. El segundo parámetro fue el número de veces que la estructura molecular fue descargada de la internet vía distintos servidores, provistas por el Protein Data Bank. Pero, para evitar que las estructuras biológicas más antiguas tuvieran una ventaja sobre las estructuras publicadas recientemente, se dividió al producto de estos dos parámetros sobre la raís cuadrada de los días que ya llevan publicadas.

La molecula que tiene el primer puesto en el ranking es el canal de potasio (KCSA) de Streptomyces lividans.
 » Potassium channel KcsA ...
Para ver todo el ranking visiten: http://www.molecularstructure.org

01 septiembre, 2009

Cual es el organismo más resistente?

Para responder a esta pregunta primero debemos preguntarnos quien es aquel organismo que puede sobrevivir a niveles extremos de radiación ionizante, a temperaturas extremadamente elevadas, a la ausencia de agua y deshidratación, a la exposición de compuestos genotóxicos, y todo esto, en el mismo individuo... El Deinococcus radiodurans (D. rad) es el organismo más resistente de todos, gracias a que posee la capacidad de reparar su ADN dentro de las 48 horas de haber ocurrido el daño.


Y no sólo eso, ahora la NASA le está poniendo mucho interés gracias a que podría ayudar a los astronautas a sobrevivir en otros mundos. Su mapa genético ha revelado su capacidad de producir medicinas, agua limpia y oxígeno, los cuales serían de vital importancia para un viaje tripulado hacia otro planeta. Además, mediante el uso de la biotecnología, la podríamos reprogramarlos para que limpien las aguas contaminadas de los relaves mineros, capturando los metales pesados responsable de una serie de enfermedades degenerativas en las poblaciones aledañas a las minas.

Y si vamos un poco más allá, podríamos investigar su capacidad de reparar su ADN para desarrollar nuevas estrategias para el combate del cáncer y otras enfermedades que tienen un orígen genético.

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