27 febrero, 2009

GTCA SsoFast, la secuela de The PCR Song

Recuerdan la canción de la PCR, de la publicidad hecha por Bio-Rad, ahora han lanzado otro video promocional, esta vez para el SsoFast EvaGreen SuperMix, que intentará superar a la famosísima PCR Song. Los creativos que están detrás de todo esto, están cambiando la forma de ver la ciencia, ya que hacer publicidades que no solo sean divertidas para los científicos sino para cualquier persona, es verdaderamente un logro.

Sin dudas este video dará que hablar, ya que fue hecha al mero estilo de The Village People (aunque me cuesta decir que se copiaron nuestra idea). Sin embargo, más que la secuela de The PCR Song, este video es la PRECUELA, ya que si recuerdan al negro que sale en el primer video, besando el termociclador, esta vez es su papá quien sale. El video empieza con el papá quejandose de que su hijo, "el negro", se paso estudiando 6 años para terminar haciendo eso... a lo que su esposa le dice "y tu ya no recuerdas que hacías lo mismo un tiempo atrás?"


Así que esta fue una primicia de BioUnalm, siempre con los videoclips y temas del verano y mostrando los futuros ganadores del Biollboard. Y para que puedan cantarla después, el video viene sub titulado.

Y si entran a su página oficial, podrán ver además las audiciones, los detrás de cámaras, entre otras, así como descargar la canción en mp3 o el video o tenerlo como ringtone.

Decora tu cuarto con tu ADN

Ya lo había mencionado antes en los accesorios para tu baño inspirados en la biología, esta vez la empresa DNA 11 crea verdaderas obras de arte para que decores tu dormitorio o cualquier parte de tu casa,... el sueño de todo biólogo es tener un cuadro con su ADN en un gel de electroforesis, teñido con bromuro de etidio y expuesto en el transiluminador UV.

Así que empieza a ahorrar, cada uno de ellos te cuesta de $225 para arriba... pero sin dudas vale la pena. Además, por promoción, puedes aprovechar de sus ofertas especiales ya que la empresa te puede aislar genes específicos como el ACTN2, el gen que se expresa en todos los músculos; NGF2, el gen que te da esa sensación de mariposas en el estómago cuando estas enamorado,... aunque también puede ser la solitaria; el gen IGF2 que está relacionado con la inteligencia o el MC1R que esta relacionado con el color de tu cabello.

24 febrero, 2009

Biodiversidad en riesgo

El día de ayer salió un artículo en El Comercio, que me pareció interesante y a la vez un poco alarmante que me gustaría compartir con ustedes para que den sus apreciaciones.

Biodiversidad en riesgo.

FORZADOS POR EL TLC CON EE.UU., EL GOBIERNO Y EL CONGRESO MODIFICARON EL PROCEDIMIENTO PARA PATENTAR NUESTROS RECURSOS GENÉTICOS. EL PELIGRO ES QUE SE HA FLEXIBILIZADO LA PROTECCIÓN DE LA RIQUEZA PERUANA Y QUE ESE ESPACIO SEA APROVECHADO POR TRANSNACIONALES
Por: Marienella Ortiz

Las últimas conversaciones entre las autoridades peruanas y las estadounidenses para terminar de armar las normas legales de la implementación del tratado de libre comercio entre ambas naciones trajo como resultado el nacimiento de nuevas reglas para el tratamiento de nuestra biodiversidad en el mundo de las patentes y la propiedad intelectual. Así entró en vigencia la ley 29316.

Pese a la prontitud con la que fue aprobada por el Congreso en este año, no pasó desapercibida y saltaron a la vista sus potenciales riesgos en cuanto al respeto y reconocimiento económico de nuestros recursos genéticos, ante su uso comercial por parte de las empresas farmacéuticas transnacionales.

Para empezar, según los expertos, la norma quita la prohibición de patentar una planta con el solo aislamiento de un gen. Tal medida estaba fijada en la Decisión 486 de la Comunidad Andina, pero quedó modificada, a pedido del Perú, como parte de la implementación del TLC.

Además, del efecto de nulidad que tenía el no contar con un certificado de origen del recurso genético o contrato de licencia para el caso del conocimiento tradicional cuando se solicite una patente, ahora queda limitado a una multa.

Los primeros en dar la voz de alarma fueron los vinculados al sector farmacéutico local. “El Gobierno Peruano permitirá la explotación de los recursos genéticos en beneficio del interés de empresas transnacionales”, sostuvo el director de la Sociedad Nacional de Industrias, José Enrique Silva.

Luis Alonso García, quien representó al Perú en las negociaciones de la mesa de propiedad intelectual del TLC, recalcó que la norma fue el resultado de la implementación, es decir, reconoce que no fue parte del acuerdo comercial. Sin embargo, considera que los cambios no afectan la protección de nuestra biodiversidad.

El mismo discurso han repetido los titulares de los ministerios de Agricultura, Carlos Leyton, y del Ambiente, Antonio Brack. Sin embargo, los expertos en temas medioambientales tienen ciertas dudas sobre lo que realmente dice entrelíneas la norma.

CRONOLOGÍA DEL PROBLEMA

Para que se entienda el tema, el director de la Sociedad Peruana de Derecho Ambiental (SPDA), Manuel Pulgar Vidal, hace una revisión de los pasos dados por el Perú.

Primero, en 1992 firmamos el Convenio de Diversidad Biológica (CDB) de las Naciones Unidas que establece una relación más justa entre el país dueño de la riqueza genética y las empresas que buscan su aprovechamiento. Segundo, la Comunidad Andina lidera esa política y formula las decisiones 391 (reglas de acceso al recurso genético) y la 486 (define lo que no es patentable). Tercero, el Gobierno Peruano fue el primero en establecer una norma de acceso a los recursos genéticos y también un registro de los conocimientos tradicionales. En suma, refiere Pulgar Vidal, el Perú siguió un camino de protección para nuestros recursos frente a la imposibilidad de jugar bajo las mismas condiciones que las transnacionales.

“Con la nueva normativa se ha dado un retroceso en estas protecciones. Nuestras capacidades de investigación están muy limitadas en relación con los países del norte”, agrega.

Lo mismo opina Antonietta Gutiérrez, catedrática de la Universidad Agraria, quien señala que “ahora sin el certificado de origen, el tema del reconocimiento de nuestros recursos genéticos queda disminuido”, apuntó.

En síntesis, señala que se nos ha restado las armas de protección que el país ha venido elaborando durante los últimos años.

INTERPRETACIÓN ERRADA

Por su parte, Luis A. García considera que existe una interpretación errada de la nueva norma. Para él, no se permite el aislamiento de un gen de una planta y que este sea patentado.

En cuanto a la multa, en vez de la nulidad de la patente, también tiene otro punto de vista. “Se estaría buscando que el Perú cuente con un sistema más efectivo (real) frente al uso indebido del recurso genético”, dijo.

Pulgar Vidal dice que una sanción (estipulada hasta en 1.000 UIT) limita nuestra capacidad de negociación en cuanto a una retribución justa de lo que obtendrá la empresa.

OTRAS ESTRATEGIAS

El presidente de la Comisión de Lucha contra la Biopiratería, Jaime Miranda, opina que la norma no nos desprotege, aunque nos fuerza a tener otras estrategias. “Requerimos trabajar una base de datos para registrar nuestros recursos genéticos y así utilizarla como un arma en todo el mundo”, explica.

Sobre este último punto, Gutiérrez considera que las autoridades peruanas pretenden hacernos creer que sacaremos ventajas del uso de las patentes, cuando a la fecha no hay estrategia ni presupuestos que lo sustenten.

Al respecto, Miranda reconoce que la Comisión de Lucha contra la Biopiratería trabaja sin presupuesto y realiza sus gestiones a través del favor de otros despachos.

Pese a todo esto, Pulgar Vidal resalta que podemos sacar provecho al mercado de los nutracéuticos (unión del sector farmacéutico y los recursos naturales), que mueve miles de millones de dólares. Para eso el Perú debe ser más celoso con lo suyo como lo vino haciendo antes, dice. Un dilema que recién empieza pero que requiere una rápida precisión del Gobierno.

Que pez tan raro

Sin duda, las extravagancias del mundo natural cada vez nos asombran más. El pez "ojos de barril" (Macropinna microstoma), tiene una óptica muy peculiar. A primera vista, ustedes creerán que esas dos protuberancias ovaladas encima de su boca son sus ojos, y que tiene una expresión de tristeza, como si hubiera visto a su chica apareándose con otro pez; pero NO¡¡¡¡.. en realidad esas cosas son sus fosas nasales. Entonces, donde están sus ojos?

Sus ojos son aquellas dos bolas, medias verdosas fosforescentes, que se pueden ver a través de su casi transparente cabeza en forma de cúpula. Este pez vive en zonas sumamente profundas, alrededor de los 800m, donde la luz casi es imperceptible; por esa razón, necesita de ojos sumamente sofisticados que le permitan vivir en estas condiciones. La disposición, forma y tamaño de sus lentes, hace que el pez tenga una visión tipo un telescopio. Además, gracias a que su cabeza es transparente -no es una imagen modificada por computadora-, se puede ver el "cableado" de sus ojos, las conexiones neuronales y de esta forma estudiar como funciona su visión.

Y esto no es todo, sus extraños ojos los puede mover tanto hacia arriba como al frente, tal como se puede ver en la figura, así que podría tener una visión tanto a la defensiva como a la ofensiva. que tiene dentro de ella. Y su extraña cabeza transparente, nos permite usmear un rato y ver que hay dentro de ella.


Robison BH, Reisenbichler KR (2008) Macropinna microstoma and the Paradox of Its Tubular Eyes. Copeia 2008(4):780-784.

23 febrero, 2009

Una metáfora para el ADN

Desde que Watson & Crick descubrieron la estructura de la molécula de ADN en 1953, se ha tratado de encontrar una metáfora que capture la complejidad de esta molécula. Algunas como "el libro de la vida", "el código de la vida", "el manual de instrucciones", "esa cosa que se usa para demostrar la paternidad", no es suficiente para expresar todo lo que significa el ADN.


Es de suma importancia encontrar una buena metáfora que comunique el significado del ADN a las masas, sin la necesidad de un conocimiento previo de biología ni usar términos complejos; y más ahora que se ha vuelto tan común hablar de él, con todos los avances en la genética durante los últimos años.

Según el biólogo David Baltimore, ganador del Premo Nobel, "el ADN va más allá de la metáfora, ya que no existe ningún dispositivo o herramienta creada por el hombre que tenga la complejidad de representación que tiene el genoma"

Por la Puna Mare

A pesar que para esta última Biolada se hicieron una gran cantidad de videos, todos en alta definición y formato 16:9, este año no habrá DVD -ya que me da flojera hacer uno y además nadie lo compra-, así que todos los videos serán colgados directamente a través del blog.

Para este primer video promocional, nos cambiamos de Youtube a Dailymotion, ya que nos ofrece una mejor calidad, más tiempo y carga más rápido; además estamos molestos con Youtube porque nos bloquearon el video de la Creación (Biolada 2006), aludiendo que infringimos el copyright de uno de los soundtracks, específicamente "Honey and the moon" de Joseph Arthur.., la verdad no se quien fue el que reclamó los derechos, ya que no creo que haya sido el mismo Joseph Arthur, ni su compañía discográfica, y además.. que esa canción estába por el final y encima es una canción y un artista "caletasa", y no creo que alguien que no sea biólogo o por lo menos molinero se haya pasado viendo los 10 minutos de aquel video, que la verdad es aburrido, sólo para verlo una vez,.. en fin, ya descubriremos quien fue el que nos acusó, y le haremos una proctoscopía con una manguera de bombero con un cultivo de Streptococcus pyogenes (sí, la bacteria comecarne) en la punta, para que lo devore de adentro para afuera, y le echaremos alcohol de 96º en cada una de sus heridas y llagas.

Como iba diciendo, el primer video promocional de la Biolada 2008, es el videoclip de la canción "Puna Mare", escrita por Daniel Ramos, donde describe las penurias que pasa un ecólogo en sus salidas de campo. Tal vez muchos se sientan identificados con la letra y se pongan a llorar.


Para todos aquellos que no fueron a la Biolada el pasado 19 de Diciembre, atentos al blog, que pronto tendremos más videos... BioJackass, Sumaq DNA Extrakshon Kid, A prueba de todo, Por qué no sustentar una tesis un sábado por la mañana... entre otros.

21 febrero, 2009

Credocida, el poder de la religión a su servicio

Te encuentras cansado de las ratas? Prueba Creedocide, el aniquilador de ratas más efectivo del mercado.


Un video para que se relajen después de tanta ciencia.

19 febrero, 2009

Los radicales libres son la causa del envejecimiento?

Por qué envejecemos? Una de las hipótesis que se maneja dice que la acumulación de los radicales libres -iones de oxígeno y peróxidos, productos del metabolismo celular- dañan nuestras principales macromoléculas, y que su acumulación provoca disfunciones en las células que finalmente la llevan a la muerte. Los radicales libres son producidos principalmente en las mitocondrias.
ResearchBlogging.org

Nuestras células cuentan con enzimas que nos liberan de estos radicales libres, principalemente la Superóxido Dismutasa (SOD), la cual convierte los superóxidos a peróxido de hidrógeno, que luego es convertida en agua y oxígeno por la catalasa. Lo que esta hipotesis dice es que con los años vamos perdiendo la actividad de la SOD, incrementando nuestra sensibilidad al estrés oxidativo, provocando así que nuestra esperanza de vida sea más corta. Este comportamiento ha sido estudiado en levaduras, moscas y ratones, donde la inactivación de la sod1 acorta su tiempo de vida, y la inactivación de sod2, además, aumenta el estrés oxidativo y muerte de las crías en ratones. La inactivación de sod3 no ha tenido un efecto negativo en la esperanza de vida, pero sí ha aumentado la sensibilidad a la hiperoxia.

Para el presente estudio se ha utilizado a Caenorhabditis elegans. Este organismo, a diferencia de los otros, posee 5 enzimas SOD: 2 mitocondriales (Sod2 y Sod3), 2 citoplásmicas (Sod1 y Sod5) y 1 extracelular (Sod4).

Primero se eliminó individualmente los genes sod y se estudió en cada mutante su tiempo de vida, comparándolo con el tiempo de vida del nemátodo silvestre (control). Se observó que a pesar que no tuvieran una de las enzimas SOD, su esperanza de vida era igual a la del control, y por si fuera poco, los sod2 mutantes tuvieron una tiempo de vida mayor que el nemátodo silvestre, lo cual es sumamente extraño ya que Sod2 es la principal SOD presente en la matriz mitocondrial. Estos resultados sugieren que en C. elegans el envejecimiento no está directamente relacionado con los radicales libres, a diferencia de lo encontrado en levaduras, moscas y ratones.

Después de observar que la esperanza de vida de los nemátodos no se veía afectada por la ausencia de las enzimas SOD, se estudió si la deleción de los genes sod mostraban algún efecto en la sensibilidad al estrés oxidativo. Como es imposible medir la concentración de radicales libres en las células, se puso a los nemátodos en 2 agentes (paraquat y juglone) que al entrar a las células inducen el estrés oxidativo. Cuando se pusieron a los nemátodos de 7 días de vida en un medio con 4mM de paraquat, lo mutantes fueron muy sensibles al estrés oxidativo, especialmente el mutante sod1. Los mutantes sod4 y sod5, no tuvieron diferencias significativas con los nemátodos silvestres. Resultados similares se obtuvieron al poner los nemátodos de un día de vida en un medio con 240uM de juglone.

También se hizo un estudio de expresión genética mediante qRT-PCR, donde se observó que si hay ausencia de un gen sod, los otros se expresan en mayor medida, lo cual contrarestaría la carencia de una enzima SOD.

Para concluir, este estudio sugiere que no todos los organismos envejecen según la hipótesis de los radicales libres y el estrés oxidativo, tal vez nosotros nos comportemos de la misma manera. Pero de todas maneras siempre consuman alimentos ricos en antioxidantes, no solo para prevenir la vejez, sino para evitar daños cardiacos y cánceres. Así que a tomar bastante chicha morada... no la Negrita¡¡¡

Van Raamsdonk, J., & Hekimi, S. (2009). Deletion of the Mitochondrial Superoxide Dismutase sod-2 Extends Lifespan in Caenorhabditis elegans PLoS Genetics, 5 (2) DOI: 10.1371/journal.pgen.1000361

Distopías de Darwin

La revista científica Discover ha publicado una galería de imágenes de las visiones más horrorosas inspiradas por la Evolución. Estas verdaderas obras de arte son exibidas en el Museo de la Yale Center for British Art con el nombre de "Endless forms" ("Formas sin fin"), desde el 12 de Febrero, día que se celebró el Bicentenario de Darwin y el 150 aniversario de su obra, "El orígen de las especies".

Para seguir viendo la galería de imágenes visiten el siguiente LINK.

17 febrero, 2009

Primera gota de agua detectada en Marte?

Cuando la nave espacial Phoenix de la NASA descendió en suelo maraciano, el pasado 25 de Mayo, capturó las primeras imágenes de lo que al parecer es agua líquida en Marte. Las imágenes muestran unas pequeñas gotas de agua cerca a las patas de la nave espacial. Aunque en la figura no se ve muy claramente, los miembros del proyecto estaban muy exitados por tal descubrimiento; ya que, al pasar los días, el tamaño de estas gotas aumentaban como si capturarán el vapor de agua de la atmósfera. Yo digo.., para ser un proyecto tan costoso, porque no invirtieron unos $1000 más para comprar cámaras que tomen fotos en Alta Definición (ahora que nos encontramos con toda la onda de lo HD), y no tener que ver imágenes tomadas con esas cámaras que parecen de los años de la pera.

A pesar de lo improbable que suene este descubrimiento, podría ser cierto ya que en misiones previas se detectó perclorato en la superficie marciana. Este tipo de sal tiene una propiedad anticongelante asombrosa, ya que puede mantener el agua en estado líquido, a temperaturas bajo cero.

La nave Phoenix, que investigaba la presencia de agua en Marte, se encontraba en una zona donde la temperatura no subía de los -20ºC. A esta temperatura es imposible encontrar agua pura en estado líquido. Pero la sal tiene un efecto anticongelante sobre el agua, es por esta razón que los mares de la Antártida no se congelan por completo a pesar que las temperaturas están bajo cero. Durante el invierno, muchas ciudades vierten sal sobre la nieve que cubre las carreteras, para que esta se derrita. Una mayor concentración de sal, bajará más grados el punto de congelación del agua. Pero el perclorato es mucho más efectivo que la sal común, ya que puede mantener el agua líquida a temperaturas que bordean los -70ºC.

Entonces, es posible que encontremos organismos vivos en estas aguas percloradas? Una forma de describir la concentracion de sales en el agua es mediante un valor llamado actividad de agua, cuanto mayor sea la concentración de sal en el agua, menor será su actividad. El agua pura tiene una actividad de 1. En la tierra existen organismos que pueden vivir en ambientes extremadamente salinos, pero aún así no soportan actividades de agua menores a 0.61 (como aquellos hongos que pueden vivir en la miel de abeja). Para que el agua se mantenga líquida a -70ºC la actividad de agua debe ser de 0.5. Si ponemos a un organismo en esta agua super salina terminará por hacerse "charki", a parte de congelarse.

Fuente:

New Scientist
Physical and thermodynamical evidence for liquid water on mars?

16 febrero, 2009

Secretos del Neandertal por revelarse

La semana pasada se anunció el secuenciamiento de los primeros tres billones de nucleótidos del genoma del Neardental, que viene siendo realizado en el Instituto Max Plank de Alemania. El secuenciamiento de este genoma es de vital importancia para entender mejor nuestra evolución, ya que éste homínido se encuentra más relacionado a nosotros que los propios chimpancés; y de esta manera poner fin a la pregunta si el Neardental fue nuestro antecesor, o compartimos con ellos un ancestro común.

Una vez que tengamos secuenciado el genoma del Neardental, podemos compararlo con nuestro genoma y determinar que diferencias son las que nos hacen "hombres modernos". Los primeros análisis comparativos de estos tres billones de nucleótidos muestran entre 1000 y 2000 aminóacidos diferentes (con los chimpancés tenemos alrededor de 50000 aminoácidos diferentes). Además estos análisis no mostraron signos de introgresión de genes de hombres modernos en el genoma del Neardental, lo cual sugiere que no hubo cruces con el Hommo sapiens, durante los años que compartíeron el territorio europeo. Para este mega proyecto se están usando restos fósiles de Neardentales hembras, extraídos de cuevas del noroeste de Croacia, junto a modernas técnicas de secuenciamiento de tercera generación.



Preguntas frecuentes acerca del Neardental

Por qué se le llamaban Neardentales?

El primer fósil fue encontrado en Bélgica por unos escolares en 1830, pero a ninguno de ellos se le ocurrió que era de un humano ya extinto. Luego en 1848, picapedreros en Gibraltar encontraron cráneos de Neradentales pero no le dieron importancia. Fue hasta el año 1856 cuando mineros del Valle de Neander (Neander tal en alemán) encontraron más huesos y cráneos que al final fueron analizados por algunos científicos.

Cuando y donde vivieron?

Se han encontrado fósiles de hasta 130000 años de antiguedad, desde España hasta Uzbekistán. También se encontró ADN mitocondrial de Neardentales en Siberia, lo cual extiende su territorio por el este. Los fósiles "más nuevos" encontrados datan de hace unos 28000 años.

Como están relacionados con nosotros?

Los Neardentales son nuestros parientes más cercanos. Aún no se sabe si son nuestros antecesores inmediatos, o si nosotros y los Neardentales decendemos de un ancestro común que vivió hace medio millón de años, y que probablemente fue africano, así como Dikembe Mutombo.
Tuvieron sexo con humanos modernos?

Si por ahí lo tuvieron, aparentemente no pudieron tener hijitos. Según los datos del ADN mitocondrial y los primeros 3 billones de nucleótidos del ADN nuclear, no se ha evidenciado la presencia de ADN de hombres modernos en su genoma.

Como eran?

Bien feos¡¡¡ con el cabello rojizo y la piel clara debido a una variante de un gen mc1r, responsable de la pigmentación de la piel y cabello. Se parcían mucho a los loquitos vagabundos de Barrios Altos.

Como se vestían?

La verdad eran bien fashon, usaban costosos abrigos de piel en el invierno y para en el verano eran nudistas.

Que comían?

Sus platos favoritos eran a base de conejos y venados, que ellos mismos cazaban. Algunos eran más sofisticados..., comían pescados y mariscos.

Eran inteligentes?

La verdad tenían un cerebro bastante grande, rondaba entre los 1200 y 1600 centímetros cúbicos (ligeramente más grande que el nuestro). Creaban armas, exhibían un pequeño comportamiento simbólico, usaban ciertos accesorios ornamentales en el cuerpo y posiblemente también imitaban el comportamiento del Hommo sapiens.

Podía hablar?

Tal vez, no una cosa que digan que bruuuto.. que tal orador, pero si tenían un lenguaje a lo Puma Carranza. Lamentablemente es muy difícil de determinar esto ya que los tejidos de la laringe o de las cuerdas vocales no se fosilizan; además hay algunas diferencias, con los hombres modernos, en la posición de los huesos de la garganta. Según algunos investigadores podían hacer ciertos ruidos, pero no podían producir el sonido de las vocales; aunque su comportamiento simbólico podría ser una evidencia de algún tipo de lenguaje articulado.

Por qué se extinguieron?

Al parecer los humanos modernos los invadieron y finalmente los desaparecieron.

15 febrero, 2009

Pastillas para las fobias

Que bueno sería tener pastillas contra las fobias y miedos pos-traumáticos. Por ejemplo; el miedo a volar de algunas personas por haber sufrido un hecho traumático en un vuelo, como un aterrizaje de emergencia; o aquí en el Perú... el miedo a ser "pepeado".

Estudios previos ya habían sugerido que al dar una dosis de propanolol -un beta bloqueante no selectivo- a personas que habían sufrido un hecho traumático como un accidente automovilístico o una violación, mostraban menos signos de estres al recordar esos hechos, pero no demostraron que si este efecto sería permanente o no.

Para llevar a cabo este estudio, el investigador Merel Kindt convocó a 60 personas saludables, entre ellas alumnos y colegas de la Unversidad de Amsterdam, luego sometió a cada uno a un shock eléctrico cuando aparecía la imagen de una araña, de esta manera condicionando la imagen con el dolor. Los voluntarios se asustaban cada vez que veían la imagen de la araña, a pesar que ya no había shock eléctrico. Luego se separó a los voluntarios en dos grupos; a un grupo se le dio propanolol y al otro un placebo. Aquellos que habían recibido el propanolol ya no se asustaban o el susto era menor al ver la figura de la araña, a pesar que recibian el shock eléctrico; en cambio los que habían recibido el placebo, el miedo persistía. Además se observó que el efecto del propanolol se extendió por los tres días que duró el experimento.

Cuando las personas experimentan eventos traumáticos, el cuerpo secreta adrenalina -también llamada epinefrina- que afecta la amígdala, que es el área del cerebro donde se procesan las emociones, estableciendo una conexión con la memoria. Esta es la razón de que al recordar los hechos traumáticos, nos estresemos y asustemos.
Lo que provoca el propanolol es bloquear los receptores de adrenalina en la amígadala, evitando que se establezca la conexión entre el evento y el miedo.

Aunque el estudio se llevo a cabo sólo durante tres días, es el primer paso hacia entender como reacciona nuestro cerebro ante los hechos traumáticos y si algún día se puedría llegar a curar todas las fobias usando sólo una pastilla.

13 febrero, 2009

Hsp70 al rescate¡

Como se puede tratar una enfermedad genética sin modificar el ADN mutante? Investigadores del Fox Chase Cancer Center, han demostrado que puede ser posible este tipo de tratamiento para ciertas enfermedades genéticas. Estos investigadores pudieron restaurar la función de un gen mutante humano en una levadura, manipulando las cantidad de una chaperona llamada Hsp70.

Las enfermedades genéticas, como su nombre lo dice, se deben a mutaciones en determinados genes que codifican para proteínas necesarias para el buen funcionamiento del organismo. Estas mutaciones hacen que las proteínas resultantes tengan uno o más aminoácidos diferentes a las proteínas sanas, provocando que cambien su estructura (plegamiento) y tengan un mal funcionamiento. Muchas veces estas mutaciones no tienen consecuencias graves sobre nuestro organismo, porque el aminoácido cambiado es de la misma naturaleza que el original, a esto se le llama "mutaciones sin sentido"; en cambio, otras mutaciones cambian un aminoácido por otro con propiedades fisicoquímicas completamente diferentes, provocando que la estructura de la proteína cambie drásticamente; o si el cambio se da en un aminoácido del sitio activo, provocará que la enzima pierda su función.

Cuando una mutación provoca un mal plegamiento de la proteína, haciendo que esta pierda su función, la Hsp70 se une a la región donde los aminoácidos están mal plegados, extiende la cadena y deja que ésta se vuelva a plegar. Los investigadores quedaron sorprendidos cuando observaron que un número significante de proteínas pudieron recuperar su función. Si este descubrimiento pudiera darse en humanos, reduciría drásticamente los efectos de muchas enfermedades genéticas, hasta podría corregirlas.

Otro experimento llevado a cabo en este laboratorio, insertó un gen mutante humano causante de deficiencia en la Cistationin β-Sintasa (CBS) en una levadura, la cual fue expuesta a un medio con alcohol. El alcohol activa las proteínas que ayudan a la célula a responder un choque térmico, entre ellas la Hsp70, las cuales evitan que la célula sufra algún daño debido al estrés al cual está sometido. El aumento de la Hsp70 mostró un efecto secundario. A parte de restaurar la función de las proteínas dañadas por el alcohol, también restauró actividad de la CBS mutante.

El ser humano posee al menos nueve miembros de la familia de la Hsp70. Este estudio sugiere que si se modificaría las condiciones del entorno de estas chaperonas, se obtendría mayores oportunidades para que las Hsp70 puedan rescatar a las proteínas mutantes.
Además se descubrió que la Hsp70 actúa en equilibrio con la Hsp26. Mientras que la Hsp70 trata de restaurar la función de las proteínas dañadas, la Hsp26 lleva a estas proteínas dañadas a los proteosomas, que es como el "basurero celular" donde van todas las proteínas inservibles. Y cuando se quitaba el gen que codificaba para la Hsp26 de la levadura, aumentó en 9 veces la función de la CBS mutante.

11 febrero, 2009

Tiburones, nuestros primos lejanos

Los tiburones están despareciendo en todo el mundo mas rápido de lo que la gente cree.

El problema de la pesca de tiburones es especialmente sangrante, teniendo en cuenta que existe una lucrativa industria en torno a la aleta de tiburón -muy cotizada en la gastronomía asiática. Los océanos han evolucionado durante centenares de millones de años con los tiburones como súper predadores. Por ello, su pérdida afectará drásticamente a la salud de los océanos que contienen el 90 por ciento de la biomasa viviente del mundo y son fuente primaria de alimento para más de cuatro mil millones de personas.

Nuestros “primos” lejanos

Hace unos 450 millones de años, los tiburones y los humanos compartían un ancestro común, haciendo de los tiburones nuestros primos distantes.

El Profesor Asociado Byrappa Venkatesh investigador principal en el Instituto de Biología Molecular y Celular en Singapur junto con su equipo determinó que los conjuntos de genes en los cromosomas, así como su secuencia genética concreta, son "altamente similar en los genomas de los tiburones elefante y los humanos". Los tiburones y los humanos comparten ciertos procesos bioquímicos y fisiológicos. Y debido a que los tiburones son los seres vivos más antiguos con una columna vertebral, los estudios sobre ellos podrían revelar cómo evolucionaron los humanos y otros mamíferos.

Evolución y caraterísticas

Hay más registros fósiles de tiburones, que de dinosaurios. La mayoría de tiburones y rayas son de crecimiento lento, se reproducen tarde y tienen pocas crías. Estas características biológicas los convierten en criaturas muy vulnerables a la presión pesquera.

Los tiburones poseen al menos siete (y quizás ocho) sentidos. Otra característica es que carecen de vejiga natatoria razón por la cual no pueden flotar. Los tiburones no pueden masticar, por eso cortan grandes trozos de su presa y los tragan enteros.

Un grupo de investigadores de la U. de Tampa en Florida, USA, reveló que tienen una mordida débil en proporción a su tamaño. En comparación con los leones y los tigres, los tiburones tienen menos poder de quijada, pero prevalecen en el mar gracias a su gran mandíbula, destaca el estudio publicado en la revista Physiological and Biochemical Zoology.

Conservación y depredación

La Unión Mundial para la Naturaleza (UICN) ha advertido que once especies de tiburones pelágicos, que viven en alta mar, de las treinta que se conocen están en peligro de extinción. Según la UICN el 21% está amenazado en el mundo y el 42% en el Mediterráneo. En el Océano Atlántico, por ejemplo, el 85% de las poblaciones de tiburones ya han sido pescados, y en el Océano Pacífico se estima que 25% de las poblaciones originales han sido eliminadas de su hábitat natural. Cada año miles de toneladas de aletas de tiburón son enviadas a los mercados de Hong Kong, Taiwán, Singapur, Japón y China principalmente.

Se debe terminar con la masacre de hasta 200 millones de tiburones que se capturan anualmente en los océanos del mundo.
Estadísticas

Los tiburones sólo matan a cinco personas cada año y en los últimos años, han muerto más personas por accidentes relacionados con caballos, o por ataques de abejas, avispas, perros y arañas que por ataques de tiburones, y por accidentes de tráfico pierden la vida 1,2 millones de personas al año en el mundo.

Jugando con los números, desde 1530, o sea en 429 años ha habido 2203 ataques de tiburones y sólo 473 han sido ataques fatales; 4.7 ataques por año. La probabilidad de sufrir un ataque de tiburón es de 1 entre 11.5 millones, según el Fichero Internacional de Ataques de Tiburón -ISAF-.

Protegerlos legalmente

El ministro francés de Pesca, Michel Barnier, explicó en una rueda de prensa que "toda la pesca directa del tiburón será prohibida en 2010".

El Ministerio de Asuntos Agrarios de la Provincia de Buenos Aires despidió el 2007 con la publicación de la Disposición 217 de la Dirección de Desarrollo Pesquero, la cual establece para la pesca deportiva, la devolución obligatoria de los grandes tiburones que habitan a lo largo de la costa atlántica: escalandrún (Carcharias taurus), bacota (Carcharhinus brachyurus), gatopardo (Notorynchus cepedianus), cazón (Galeorhinus galeus) y tiburón martillo (Sphyrna spp.), "quedando estrictamente prohibida la captura con sacrificio de los mismos". Más información ASOCIACIÓN ÑANDE YBÝ - NUESTRA TIERRA - www.nandeyby.org

Los representantes de los distintos gobiernos deberían tomar nota de las sombrías advertencias que se formulan y proteger a los tiburones con legislación específica a nivel internacional, regional y nacional.

Conclusión

El control de la pesca ilegal de tiburones es difícil porque no hay restricciones en aguas internacionales. Adenás hay planes pero pocas acciones para la conservación de los tiburones.
Los tiburones necesitan de nuestra ayuda y no podemos empujarlos al borde de la extinción.

Por Norberto Ovando.

10 febrero, 2009

Lo que la NASA oculta

Siguiendo con los cortos por el Año Internacional de la Astronomía, alguna vez se han preguntado, por qué dejamos de ir a la luna? Eh aquí la respuesta:

09 febrero, 2009

Semana de Darwin

Ya estamos a escasos días del 200 cumpleaños de Darwin. Se están realizando una serie de actividades por todo el mundo conmemorando el bicentenario de nuestro amigo Charles. Además también se cumplen 150 años de la publicación de su obra más importante: "El orígen de las especies"

A Darwin se le debe muchas cosas ya que su concepto de la Evolución no solo explica el origen de las especies, también explica temas del amor, política, economía y el cosmos. La teoría de la evolución fue la primera de las tres revoluciones intelectuales del mundo moderno, junto a La interpretación de los sueños de Sigmund Freud (1899) y la teoría de la relatividad de Albert Einsten (1905).

Aquí algunos links de interés:
http://www.darwinday.org/
http://darwinday.bham.ac.uk/
http://discovermagazine.com/2009/mar/04-discover-does-darwin
http://www.newscientist.com/article/dn16388-darwin-anniversary-books-pick-of-the-crop.html
http://www.scientificblogging.com/darwin_day_2009

07 febrero, 2009

Como se activan los genes de M. tuberculosis?

La tuberculosis ha sido una de las enfermedades más devastadoras de todos los tiempos. Durante muchos años se ha investigado quien controla la activación o inactivación de los genes del Mycobacterium tubrculosis, pero hasta ahora no se han tenido resultados alentadores. Dos laboratorios estadounidenses por fin revelaron la estructura del "interruptor metabólico". La proteína receptora de AMP cíclico (CRP) es la proteína responsable y se encuentra en muchos tipos de bacterias, por un lado tiene un sitio de unión al AMP cíclico (AMPc) y por el otro, un sitio de unión al ADN.

Cuando la proteína se une al AMPc, se "enciende" y se une al ADN. Esta unión es la responsable de activar ciertos genes que les permite a las bacterias sobrevivir en condiciones adversas, y por lo tanto, ser más virulentas.
Hasta ahora solo se sabía esto, pero cual es el mecanismo que hace que la proteína se una al ADN luego de unirse al AMPc? Lo que se creía era que había un cambio de forma en la CRP tras su unión con el AMPc. Los investigadores se pasaron 25 años analizando las estructuras de la CRP inactiva (sin AMPc) y activa (con AMPc), pero nunca encontraron diferencia alguna entre ellas. Usando la CRP de E. coli, los investigadores cristalizaron la proteína "encendida", y mediante la difracción de rayos X pudieron determinar su estructura. Pero la CRP "apagada" siempre se resisitió a la idea de ser cristalizada, por eso no pudo determinarse su estructura, haciendo imposible compararla a la CRP activa.

Hasta que por fin, investigadores de dos laboratorios estadounidenses sustituyeron la CRP de M. tuberculosis por la CRP de E. coli. Gracias a esto pudieron, después de casi 30 a los, cristalizar la CRP "apagada" y determinar su estructura. Aunque la CRP de M. tuberculosis presenta dos subunidades que son genéticamente idénticas, fue grande su sopresa al observar que estas subunidades no eran estructuralmente simétricas en su forma inactiva. Este fue un hallazgo muy raro ya que la mayoría de las proteínas que tienen dos subunidades genéticamente identicas, estas casi siempre son simétricas. En la figura podrán apreciar las estructuras de las dos subunidades, las partes de blanco son las asimétricas.

La hipótesis que se maneja es que es la asimetría en ausencia de AMPc es lo que previene que la CRP se una al ADN, para así mantenerse inactiva cuando no se requieren los genes para condiciones adversas. Ahora solo falta cristalizar la CRP activa para determinar su estructura y poder demostrar si es la simetricidad la que la vuelve activa. Revelar este mecanismo sería un gran avance en la producción de nuevas drogas capaces de mantener inactiva la CRP y así poder contrarestar sus efectos en nuestro organismo.

Referencia:

D.T. Gallagher, N. Smith, S-K Kim, H. Robinson and P.T. Reddy. Profound asymmetry in the structure of the cAMP-free cAMP receptor protein (CRP) from Mycobacterium tuberculosis. Journal of Biological Chemistry.

06 febrero, 2009

Secuencia tu genoma por solo $5000

Desde que fue terminado el Proyecto del Genoma Humano, muchas empresas empezaron a ofrecer servicios de secuenciamientos de genomas. La primera persona que secuenció todo su genoma fue James Watson, sí... el mismo que descubrió la estructura en doble hélice del ADN, en el año 2007. A nuestro amigo Watson le costó alrededor de un millón de dólares, que seguró lo pagó con la plata que le dieron por su Premio Nobel.

A partir de entonces muchas compañías empezaron a trabajar para reducir estos costos y ofrecer el secuenciamiento de genoma humano como un servicio cotidiano. El año pasado, la compañía Applied Biosystems, anunció el secuenciamiento del genoma de un nigeriano por sólo $60000. Pero, ahora la empresa Complete Genomics, ha bajado este costo a la décima parte, cualquier compañía o investigador podrá secuenciar un genoma humano por sólo $5000 a partir de Junio de este año...

Se imaginan ver un infomercial de un secuenciamiento de genoma humano?... "Llame ya¡¡ aproveche esta oportunidad de secuenciar su propio genoma y sea el más popular de su clase... todo por $4999.99.., y si llama en los próximos 20 minutos, llévate un segundo secuenciamiento completamente gratis¡¡¡, el mejor regalo para su pareja para este Día de San Valentín".

Además, Complete Genomics podría ser ganador del Archon Genomicas X Prize, quien ofrece 10 millones de dólares al primer equipo que logre secuenciar 100 genomas en menos de 10 días. tiene la tecnología para hacerlo ya que posee sistemas de secuenciamiento que permiten obtener 8.8Gb (Gigabases) por máquina por día, y un total de 70Gb por cada corrida. Por si fuera esto fuera poco, están pensando en incrementar en 3 veces este rendimiento para este año, a fin de poder ofrecer el secuenciamiento de genomas como un servicio cotidiano.

Este bajo costo permitirá a muchos investigadores, encontrar y comparar pequeñas mutaciones puntuales, en diferentes personas, para así poder explicar las causas de muchas de las enfermedades genéticas. Complete Genomics

05 febrero, 2009

El basurero de BioUnalm?

Para publicar un artículo en BioUnalm, me paso unas horas leyendo papers, reviews, comentarios y noticias de diversas fuentes -no soy de "copy y pegy"- de los cuales, muchos artículos me parecen sumamente interesantes y me llaman la atención. Pero, si se habrán dado cuenta, sólo algunos son publicados, entonces... Que pasa con todos esos artículos que no han sido publicados.., que han sido censurados.., rechazados por el editor -que yo mismo soy-, que han sido "baneados" por diversas razones?

Antes simplemente los botaba, ya que publicarlos en otro día no era la mejor idea, porque la novedad ya pasó, entonces me dije... "mejor en vez de botarlos, porque no crear un blog para ellos?... y además darle otra tonalidad, algo más informal... menos serio y sin temor a equivocaciones y rechazos por la comunidad científica... fue así que nació el basurero de BioUnalm, donde se bota todo aquello que no se publica en BioUnalm.com La dirección es la siguiente:


Bueno, para no aburrirlos, espero que también visiten nuestro basurero, se enterarán de muchas cosas que aca no lo harían, y OJO no dejen de visitar este blog.

04 febrero, 2009

La química puede ser divertida II

Recuerdan aquel post de la , si no la recuerdan aquí el video, donde aparece un Hidrógeno recontra gay, que no se siente muy bien bailando con el Helio porque es mujer, pero cuando llega el Carbono, ahí si sus electrones se le exitan.

Pero ahora encontré otro video, que es similar al anterior pero con otros detalles más, donde viene el Zinc y desplaza al gay del Hidrógeno, donde aparecen los gases nobles marginados por no poder enlazarse con ningún átomo.

02 febrero, 2009

La acidificación de los océanos podría desorientar a los peces

Recueran la película Buscando a Nemo? La verdad yo no porque no la ví, pero si lo han estado buscando me imagino que fue porque se había perdido. Y por qué se perdió? Según lo que leí fue porque un buzo lo capturó, cuando se separó de sus compañeros de excursión. Pero según un artículo publicado en PNAS, es la acidificación de los océanos debido al incremento en las concentraciones de CO2 en el aire.

Los peces payasos usan su sentido del olfato para regresar a los arrecifes de donde nacieron, después de haber pasado su etapa larval. Además su olfato les permite dirigirse hacia los bancos de anémonas donde suelen pasar la mayor parte del tiempo.

Los mares absorben el CO2 del aire ya que este gas es muy soluble en el agua. El CO2 puede reaccionar con las moléculas de agua formando ácido carbónico el cual aumenta la concentración de iones Hidrógeno (H+) en las aguas, bajando el pH de los océanos.

Philip Munday de la Universidad James Cook de Australia diseño un experimento para hacer este estudio. Puso a los peces payaso una cubeta con dos canales de entrada y uno de salida (como se muestra en la figura). Cada uno de los canales era cargado con un diferente aroma; en uno se ponía olores atractivos para los peces payaso, como de las anémonas o del Xanthostemon; y en el otro se ponía olores desagradables para ellos, como de la Melaleuca o de los pantanos.

Se puso primero a los "Nemos bebes" en la cubeta con agua a pH 8.15 -similar al pH de los océanos- y ellos respondieron tal como se esperaba, nadaron hacia los olores que eran atractivos para ellos. Luego se cambió el agua por una con un pH 7.8 -que es el que se espera para el 2100- y los peces ya no se comportaban de la misma manera, algunos todavía nadaban hacia los olores que para ellos son agradables, pero lo hacían en menor grado. En el control evadían completamente el agua con Melaleuca, en cambio a pH 7.8 pasaban el 80% de su tiempo ahí. Para fianlizar con los experimentos, se puso a los peces a un pH 7.6, en este punto los resultados fueron los "más peores", los peces ya ni siquiera respondían a los olores, las larvas de los peces payaso no tenían preferencia por ninguno de ellos.Si bien estos resultados son alarmantes, no se sabe si pueden ser extrapolados a otras especies o a condiciones reales, ya que es extremadamente difícil medir el pH del océano con una exactitud de ± 0.1. Además, si los océanos se irán acidificando constantemente durante los próximos años, la adaptación genética jugará un papel importante para que estos peces vivan tranquilos a pH cada vez más bajos?

Lo cierto es que la caída del pH de los océanos tiene un mayor efecto sobre algunos ecosistemas como los arrecifes de coral, que poco a poco ser iran disolviendo tal como una concha lo hace en una solución ácida, así como en la propaganda de Colgate. La pérdida de este ecosistema traerá consigo la perdida de cientos de especies marinas, llenemos de Colgate los mares¡

Referencia:

PNAS; doi: 10.1073/pnas.080999610
http://www.pnas.org/content/early/2009/02/02/0809996106.full.pdf+html

01 febrero, 2009

Para que sirven nuestras huellas dactilares?

Para poder capturar al asesino? o tal vez para tener un mejor "agarre" con las cosas lisas y resbalosas?. De hecho, hasta ahora los científicos no estaban completamente seguros del propósito de estos pequeños surcos de nuestras huellas digitales y la forma de como ellas evolucionaron. Una hipótesis sugiere que podría mejorar nuestro sentido del tacto. Ahora, un grupo de físicos han podido dar evidencias para validar esta hipótesis.

Alexis Prevost y compañía diseñaron dos pequeños parches que imitan a la piel que está sobre nuestros dedos. Uno de los parches tenía surcos paralelos en la superficie, del mismo grosor y profundidad de nuestras huellas digitales, mientras que el otro tenía una superficie completamente lisa. Tras una serie de experimentos, concluyeron que aquel parche con los surcos en paralelo mejoraban la percepción de las texturas gracias a que incrementan las vibraciones en la supericie de la piel, lo cual estimulan de mejor manera a los corpúsculos de Pacini.

La información de la textura juega un rol importante en nuestra abilidad para identificar objetos mediante el tacto.
Estos parches artificiales usados en los experimentos, fueron diseñados a partir de un material plástico con propiedades similares a la piel huamana, el cual cubría un sensor de medio milímetro de ancho. Hicieron pasar cada parche por la superficie de un pequeño trozo de cristal, grabado con finas líneas a través de ella, y midieron las vibraciones producidas usando el sensor. El parche que asemejaba a la piel de los dedos experimentó vibraciones 100 veces más fuertes que aquel parche con la superficie lisa.

Estos resultados han sido muy importantes ya que han permitido develar algunas de las propiedades físicas y mecánicas de la piel humana, sobre todo, la importancia de las huellas digitales para seleccionar y amplificar las señales de los diferentes tipos de texturas y el efecto que tienen sobre los corpúsculos de Pacini y el sistema nervioso.

Ahora quedan algunas preguntas más por revelar.., porque nuestras huellas digitales tienen esas formas tan complejas?, porque están dispuestas en formas de remolinos elípticos? Según los experimentos, las vibraciones fueron más fuertes cuando se pasó el parche de manera perpendicular a las líneas grabadas en el cristal. Tal vez la forma de remolino de nuestras huellas digitales sirven para experimentar la misma textura, sin importar el ángulo con el que movemos nuestros dedos sobre el objeto. Por ejemplo, los monos poseen surcos paralelos en toda la longitud de sus dedos, así que estos remolinos pueden ser una evidencia de que estamos más adelante evolutivamente que los monos, o que los monos usan de manera diferente los dedos para explorar las superficies.

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